咳嗽腰疼，首先要考虑的是不是咳嗽太剧烈，拉伤了肌肉导致的疼痛，或者是有一部分患者可能是肋间神经的损伤，也会引起疼痛。主要的是来考虑有没有外伤，另外，应该拍个胸片或者做个B超，有时候是反射痛，感觉是腰痛，其实有可能是胸膜刺激导致的胸膜炎，所以应该拍个胸片或者CT明确排除胸膜炎。
另外，如果咳嗽同时有尿急、尿频、腰疼，要考虑会不会有呼吸道和泌尿系同时感染的可能性。腰疼一般出现在肾盂肾炎更明显，也就是上呼吸道感染，容易引起肾盂肾炎这一类的疾病。所以当出现咳嗽又有腰疼，除了拍胸片以外最起码做尿常规的检查，或者有条件时做双肾的B超，或者是泌尿系统的B超。