Graves眼病的自然病程是两年半左右，目前使用抗甲状腺药物治疗Graves眼病伴甲状腺功能亢进症的方法，仅是对症治疗，不是对因治疗，为了保证整个治疗过程的全程覆盖，强烈建议在专科医生的指导下，坚持规律服药2.5-3年的时间，化验各项检查功能指标均在正常范围之内，并且甲状腺自身抗体转为阴性者，才可以考虑停药。
目前教科书中推荐服用药物一年半，也就是18个月，不能够达到疾病治疗的全程覆盖，这就造成了停药后甲状腺功能亢进症复发率高的一种现象，因此不推荐短疗程的治疗方法，服用抗甲状腺药物达到三年是患者必须高度重视的一个方面。