继发性癫痫小发作，通常情况下要找到癫痫的病因，针对典型病因治疗，之后再给予抗癫痫药物治疗，根据发作类型进行选择。
同时要监测病情变化，比如海绵状血管瘤引起的癫痫小发作的情况，通过微创手术，去除海绵状血管瘤，给予部分性癫痫药物治疗，通常通过两年治疗无发作，可以逐步停药、减药，最后无发作，就会消失，叫做治愈。一般到了五年停药后仍然没有发作，就认为是治愈。