益生菌能够促进营养物质的吸收，可以合成消化酶，与人体合成的消化酶一起参与肠道中营养物质的消化，还可以提高机体的免疫力。益生菌的自身结构，如肽聚糖、磷壁酸等成分可作为抗原直接发挥免疫激活的作用，还可以维持肠道菌群的平衡。
肠道不仅是机体正常的组成部分，参与机体重要的生理活动，同时肠道中还存在着复杂的肠道菌群，对宿主的生长、发育和健康等方面发挥着重要的功能。益生菌还能够提高机体的抗氧化水平，抑制肠道的炎症，保护肠保护肠道的黏膜屏障，因此非常适用于消化不良、便秘、腹泻、肠道菌群失调的病人。