咪喹莫特乳膏主要的功效是抑制组织增生，对于特异性的皮肤增殖有一定的消除作用，单纯对于HPV病毒感染有一定的抑制功效。一般小剂量涂抹可以防止尖锐湿疣或者扁平疣等疾病复发，而大剂量涂抹具有一定腐蚀性作用，可以使突起皮肤症状得到消退。
如果涂得太多，可能会对皮肤造成刺激，形成烧伤样改变，局部除了会出现破溃以外，还会伴随着明显的疼痛、灼热等症状。如果想要选择使用这种药物来进行治疗，需要严格按照说明书进行隔日一次治疗，而且涂抹几个小时之后需要用清水或者清洁产品清洗掉，避免药物长时间作用于皮肤表面，造成损伤性刺激。