某些卵巢囊肿是可以引起月经不调的，特别是某些性索间质的肿瘤，比如颗粒细胞瘤或者是卵泡膜细胞瘤，这些肿瘤常常可以分泌激素，而这些激素作用于子宫就可以出现月经不调的症状。同时大部分卵巢囊肿对卵巢本身是一个破坏，它可以引起卵巢功能的异常，这时候也会出现月经不调。
但是卵巢囊肿本身是不是引起月经不调，与其肿物的大小关联并不大，因为卵巢的储备功能还是比较强的，有很强的代偿性，所以有些很大的卵巢囊肿仍然没有出现月经不调的症状，这也属于正常现象。卵巢囊肿是否引起月经不调，主要看其组织成分，并不是看它的大小。