甲钴胺和维生素B12是有一定区别的，在分子方面，甲钴胺是维生素B12的甲钴胺制剂，是一种广泛存在于血液和脊髓液中的辅酶B12，是甲基化的维生素B12。维生素B12是一种含有金属元素的维生素，也就是说甲钴胺是维生素B12的一种。在治疗作用上，两者都有营养神经的作用，对各种神经疾病的治疗有促进恢复的作用，效果要以甲钴胺为明显，维生素B12次之，二者都有口服制剂和针剂。在经济上，甲钴胺的价格要贵，维生素B12相对便宜，结合两者的疗效，目前在临床上以甲钴胺使用次数最多。