肠易激综合征有明显家族遗传倾向，国外33%患者有家族史，国内与此相近，而且每一家族中肠易激综合征患者临床表现也类同。
有人发现腹泻型和便秘型肠易激综合征，以女性O型血比较多见，腹痛性肠易激综合征以B型血多见。女性肠易激综合征患者中65%有家族史，双亲中患肠易激综合征者以母亲为多。肠易激综合征患者同胞中，患肠易激综合征以同性别为多。很多家族中有许多人患有肠易激综合征，说明这种疾病可能会遗传给下一代，特别是有直系血缘关系发生率会更高，所以肠易激综合征可能会遗传。