嗜碱性粒细胞百分比偏高，对人体的危害主要取决于导致嗜碱性粒细胞升高的原发疾病，大致情况如下：
1、过敏性疾病：会出现嗜碱性粒细胞百分比偏高，过敏性肠炎的患者也会出现嗜碱性粒细胞偏高。在这种情况下，可引起患者出现腹痛、腹泻、恶心、呕吐等并发症。
2、荨麻疹：嗜碱性粒细胞百分比偏高，患者会出现局部皮肤的皮疹，伴有瘙痒明显。
3、血液系统疾病：例如慢性粒细胞白血病，导致嗜碱性粒细胞升高，会出现贫血的症状，表现为头晕、乏力、面色苍白，活动后感心悸、气短、胸闷，严重的患者会引起心肌供血不足，导致贫血性心脏病，对患者的身体健康带来严重的危害。
4、真性红细胞增多症：也会引起嗜碱性粒细胞偏高，这种疾病给患者带来的危害，主要是容易发生血栓或栓塞性疾病。