慢性附睾炎的治疗目标并非治愈，临床治疗目标即控制急性发作且与其和谐共处，因该疾病的治愈困难较大，建议患者遵医嘱口服抗生素2-4周。
老百姓所认为生殖系统的慢性感染治愈非常困难，附睾炎、前列腺炎等慢性感染性生殖系统疾病，临床治疗目标即控制急性发作，且需学会与慢性的症状和谐共处。慢性附睾炎症状在临床上较少见，因急性附睾炎肿胀、疼痛，较多患者会及时就诊，通过及时治疗不会转变为慢性附睾炎。个别患者因当时急性发作期时，就诊条件不方便或治疗措施不到位，可转变为慢性附睾炎，患者可感觉到附睾有硬结且隐隐作痛，建议慢性附睾炎患者遵医嘱口服抗生素2-4周。
建议患者同时忌酒、忌烟、避免久坐、多运动、多锻炼、低盐低脂饮食，避免摄入辛辣、刺激的食物，还需多饮水。