闭经分为原发性闭经和继发性闭经两种，原发性闭经是指年满16岁月经尚未来潮，继发性闭经是指按照原有的月经周期，推迟三个月尚未来潮者。其中原发性闭经比较少见，多数是由于遗传学因素或者先天发育缺陷引起。
继发性闭经的原因比较复杂，但是从根本上讲就是和下丘脑-垂体-卵巢轴的性腺轴以及子宫有关系。
因为只有性腺轴功能正常，分泌的激素作用于子宫内膜，才会有月经的出现。比如精神压抑、过度紧张、过度疲劳、严重消瘦都可以导致闭经，垂体肿瘤、卵巢早衰、多囊卵巢综合征、子宫内膜炎，宫腔粘连同样会导致闭经。
另外，甲状腺功能亢进、甲状腺功能低下、肾上腺皮质功能亢进和闭经也有关联。