新生儿黄疸分为生理性黄疸和病理性黄疸，对于生理性黄疸多数不需采取干涉治疗，主要注意加强喂养，多吃、多排大便，密切观察，一般的孩子可以自行消退。
对于病理性黄疸，需要在光疗、药物治疗等前提下明确引起黄疸的原发病，并针对原发病进行治疗。目前的光疗是治疗新生儿非结合胆红素升高的主要方法，通常采用连续照射的方法，光疗过程中要注意监测血清胆红素的水平变化。另外还有药物治疗，首先是免疫球蛋白，输注免疫球蛋白，治疗血型不合溶血引起的高胆红素血症。另外还有补充白蛋白，补充白蛋白是结合游离胆红素降低血液中的胆红素水平。
还有其他的换血疗法，换血疗法的通常用于重症新生儿溶血、严重的败血症等疾病，对于黄疸水平高、进展快的新生儿，有核黄疸症状的患儿，具有换血的治疗指征。