马鞍区感觉障碍主要是由于马尾神经受到压迫或刺激产生这一临床症状，首先建议行腰骶椎的核磁共振检查以明确病因。
临床常见的病因是腰椎间盘突出，腰椎间盘的巨大突出压迫以及刺激马尾神经会产生鞍区的感觉障碍。
另外，外科手术麻醉以后，做腰硬联合时会损伤脊髓，也会产生鞍区的麻木或感觉障碍。
另外脊髓内的占位性病变，特别是胸段以下的髓内占位性病变，会产生马鞍区的感觉障碍。
临床另一种情况也值得关注，即脊髓栓系综合征，这种病变除外马鞍区的感觉障碍外，还会有患肢的高弓内翻马蹄足，对于重症的马尾神经损伤患者，会伴有二便的改变，如尿失禁或者便失禁。