儿童肾病综合征不会自愈，它是一个慢性的肾脏疾病，治疗过程是一个缓慢的过程，常伴有很多并发症，所以是不可能自愈的，转归也要跟具肾病综合征的病理类型而决定。
儿童肾病综合征的转归分为以下几种：1、临床治愈,完全缓解，停止治疗大于三年没有复发。2、是完全缓解，生化和血尿常规均为正常。3、是部分缓解，尿蛋白阳性小于(+++)，未缓解尿蛋白阳性大于等于(+++)。
儿童肾病综合征的预后和肾脏病理类型密切的相关，微小病变绝大多数对激素敏感，随70%左右的患儿会有1-3次的，甚至多次的复发，但预后良好。而局灶节段性肾小球硬化仅有20%的敏感，既往数据显示40-50%的患儿在10-15年内发展至肾功不全预后不良。此外并发症已影响预后，部分患儿可以死于感染和栓塞合并症，所以它不可能自愈，治疗起来也是一个很漫长、麻烦的治疗过程。