动脉血栓一旦产生很容易发生严重的后果，包括剧烈的疼痛以及超过六小时引起的肢体坏死，一旦发生动脉血栓应尽早进行积极治疗，包括常规手术下的取栓治疗、腔内治疗，将血栓及斑块使用支架压在血管壁上，恢复血管的血供。
同时可以应用药物，如扩血管、改善循环、抗血小板甚至抗凝治疗，以避免血栓再次形成。应积极查找动脉血栓发生的原因，是否存在心脏内的血栓或其他斑块脱落的情况。