心脏球囊和心脏支架还是有很大区别，虽然它们都能够作为扩张血管的器械来使用，但是心脏球囊又分为很多种，有扩张性普通球囊，主要是在支架植入前或支架植入之后，起到扩张血管的作用，并不能够起到长期的维持血管通畅的目的。目前临床上有新出现的药物性球囊，球囊表面涂一些抑制血管内皮增生的药物，可以来抑制血管内皮增生，来防止动脉硬化再进一步进展这种功能。这样的药物球囊目前在临床上应用较为广泛，主要是将药物留在血管的表面，而并没有像人体内植入任何外来的器械，所以从这点上来讲，它具有优势。
心脏支架是向人体内植入微小型的支架，然后在普通球囊的支撑下进行释放，这样在人体当中就会留下了这样心脏的支架，起到支撑血管的作用，所以二者最大的区别就在于是否向体内植入了异物。