脑炎恢复期又发烧了，可能要赶紧再化验血和做腰穿，查脑脊液，看看脑脊液是不是出现加重的趋势。如果是有加重的趋势，可能脑炎又复发了，这种情况还要给予积极的针对脑炎的病因治疗。如果是细菌感染，要给予调整抗生素，病毒感染要加强抗病毒的治疗。
要积极的对症治疗，主要是降颅压、调整水电解质紊乱等，避免因为脑炎造成的并发症而加重病情的发生。如果不是因为脑炎关系，可能是继发的肺部感染，也要积极的治疗并发症。通过选用针对肺部感染合适的抗生素来进行治疗，尽可能的改善因此引起的并发症，避免诱发脑炎的复发。