哺乳期阴道炎的用药要根据阴道炎的类型来决定，如果存在滴虫性的阴道炎，治疗采用抗滴虫的药物，主要的治疗药物为硝基咪唑类药物。初次治疗可选择甲硝唑或替硝唑，口服药物的治愈率达到90%-95%。服用甲硝唑的患者在服药后的12-24小时内避免哺乳，服用替硝唑的患者在服药后的三日内要避免哺乳。
如果存在细菌性阴道炎，它的治疗主要是针对厌氧菌的治疗，首选的药物就是甲硝唑类的药物，哺乳期的女性应该选择局部用药比较适宜。