头孢菌素类抗生素可引起速发型过敏反应，亦可以引起迟发型过敏反应。迟发型过敏反应较罕见，一般在用药半小时至一天后，甚至3-5天后发生，速发型过敏反应一般发生在应用头孢菌素半小时内。
速发型过敏反应主要表现为皮疹、全身疼痛、发热、出汗、呼吸困难、心跳加快、血压下降，从脸部开始出现肿胀，进而出现休克。如不及时抢救，可迅速导致患者死亡。迟发型过敏反应轻者表现为皮疹哮喘、发热，重者可发生休克，危及生命。鉴于上述情况，目前各地医院采用的方法是在静点头孢菌素类抗生素前都进行皮试，尤其对于有过药物或其它过敏史的人群，还要提前准备好应对措施。如果皮试阳性，就需要改用其它抗菌药物。
注射头孢过敏后应立即停止用头孢类药物，通常很多人停药后几分钟就会好转。症状轻微的患者，如仅有皮肤发痒等，可以给予地塞米松、苯海拉明肌注。