自身免疫脑炎最新的治疗方案，一般用免疫球蛋白治疗，一般疗程15天。还有血浆置换的治疗，以及大剂量激素冲击疗法，可以选用一种方法或者两种方法联合应用来治疗自身免疫性脑炎。
根据症状情况，还要给予对症治疗的药物，包括营养神经、改善脑功能药物等。急性期治疗以后，还有一部分患者需要给予免疫抑制剂来进行免疫调控治疗，缓解和改善症状。