肺脓肿是肺部急性感染性的疾病，通常属于比较严重的疾病，但是大多数都可以达到临床治愈，极少数即使全身抗感染治疗，也很难得到治愈，必要的时候可以借助手术切除的方法，联合全身抗感染治疗。只是导致肺脓肿的致病菌不完全相同，有的肺脓肿可能是混合致病菌感染，因此，要多种抗生素联合使用。
通过药物治疗可以得到缓解的患者，通常不需要手术切除，手术切除通常是药物治疗无效的患者。鉴于手术切除损伤较大，加上肺组织被部分切除，可能会对肺功能产生一定的影响。但肺脓肿可以被治愈，只要及时进行正确的抗感染治疗，酌情给予手术切除，大多数患者可以达到临床治愈。