脑血栓溶栓治疗有30%的患者可以获益，症状可以得到明显缓解，神经系统体征可减轻，60%的患者症状无缓解也无加重，10%的患者可能出现症状进展加重，甚至出现脑出血，从而危及生命。
溶栓的风险包括全身出血，有消化道出血、泌尿系出血、全身皮肤黏膜出血等，还可以出现药物过敏的反应、血管神经性水肿、皮疹、过敏性休克，甚至危及生命，还有的可转成了脑出血。此外，溶栓后再灌注可引起脑水肿加重，导致脑疝，从而危及生命，溶栓后病情加重者可以有生命危险，还有溶栓后可再次发生脑梗死。有60%以上者溶栓无效，10%病情继续进展，甚至可发生脑出血而引起死亡。如果患者有高血压、心脏病、糖尿病、肝肾功能不全、静脉血栓等疾病，或者高龄、有吸烟史，发生以上风险的可能性都会加大。