单纯的阴道镜检查不会引起疼痛，但是临床上阴道镜多用于指导阴道镜下宫颈多点活检，宫颈活检会有轻微的疼痛感，但是并不严重。
对于宫颈TCT和HPV异常者，要选择进一步行阴道镜下宫检颈多点活检。宫颈局部涂醋酸，病变部位会表现为醋白上皮，边界清晰，白色病灶隆起。对于醋白上皮要取活检送病理学检查，明确诊断，要多点活检，但是每一处活检部位直径在几毫米，很少引起明显疼痛，做阴道镜前需要排除阴道炎或者等其他感染疾病。
此外，患者需注意做阴道镜必须等到月经结束之后，一般适合在月经干净后两周内进行。检查前的24个小时以内不要在阴道上用药或者是冲洗，不作内诊及宫颈刮片，以免影响检查结果。