查不出原因的发热确实存在比较顽固性的疾病，反复发热但是不能够明确病因，超过一周以上，称为发热待查，不是发热一天就诊断发热待查。常见的原因可能是比较隐匿性的原因，像一些不常见的细菌、病毒、支原体，还有一些像螺旋体、真菌、寄生虫、立克次体，这些相对来说不是常见的病因，可能会造成不明原因的发热。积极寻找病因之后，明确诊断，就能够针对病因处理。
非感染性的因素也可能造成不是很明显的发热的情况，有的孩子出现创伤、骨折、内脏出血，或者血液系统的疾病，像白血病、恶性肿瘤，都可能造成非感染性的发热。还有变态反应性的疾病，外源性的变态反应抗原抗体复合物，都可能成为致热原，引起孩子出现发热的现象，像药物热、血清病等。
还有中枢神经系统的问题引起的发热，致热因素可能不是通过致热原造成的，而是因为体温调定点出现了反复波动，中暑、药物、颅内出血、肿瘤都可能造成。所以孩子如果查不出原因，还是要坚持检查，明确诊断才能对症治疗。