治疗反流性食管炎最重要的是抑酸的药，因为反流性食管炎产生的原因是胃内的内容物，也就是胃酸反流到食管当中，腐蚀食管形成了反酸、烧心这样的症状。
在胃镜下可以看到食管条状的糜烂，所以反流性食管炎的病因是胃酸腐蚀食管导致的。
这个时候患者需要使用抑酸的药，降低胃内容物当中酸的浓度，也就是升高pH值，才能达到治疗的目的。
同时要用一些胃黏膜的保护剂来保护食管的黏膜，还可以使用一些动力的药，比如吗丁啉、莫沙必利等来促进胃的排空，来改善反流性食道炎的症状。