肠套叠灌肠治疗主要分为三种，分别是空气灌肠、钡灌肠以及B超监视下水压灌肠复位，具体如下：
1、空气灌肠主要是通过向结肠内注入空气来实现肠复位，适用于患者病程在48小时内，全身状态比较良好或者发病超过48小时，但是没有出现明显脱水、腹胀的情况。
2、钡灌肠与空气灌肠相似，只是把介质换成硫酸钡。
3、B超监视下水压灌肠主要是将温热的0.9%氯化钠注入到结肠中，同时用B超进行扫查，由此来观察溶液由乙状结肠慢慢充盈肠管，并且流到肠套叠部位，同时还可以用手按摩患者的腹部，以此来加快溶液的流动，实现复位。
患者如果病情比较严重或者灌肠治疗效果不佳，则需要通过腹腔镜手术来进行治疗。