对于口服恩替卡韦抗乙肝病毒治疗的患者，不建议擅自停药，停药的指征要求很严格。对于口服恩替卡韦治疗前是乙肝大三阳的患者，应该在乙肝大三阳转为乙肝小三阳，同时病毒学转阴、肝功能持续，这种状态持续三年以上才可以考虑停药。
对于口服恩替卡韦治疗前是乙肝小三阳的患者，在病毒学转阴、肝功能正常，同时乙肝表面抗原转阴的情况下，才可以考虑停药。对于口服恩替卡韦治疗前已经是肝硬化的患者，即使是肝硬化代偿期或者是肝硬化早期的患者，也不建议停药，建议终身服药，如果停药可以出现病毒的反弹，甚至出现肝功能衰竭。