乙肝病人抗核抗体阳性，则说明可能同时合并了自身免疫性肝炎。抗核抗体又称ANA，是风湿免疫科比较常见的一个检查项目。目前自免肝通常也会检查自免肝系列，其中也有抗核抗体的项目。抗核抗体的出现主要是人体的免疫系统出现了问题，一旦有细菌、病毒进入体内，会产生一些针对自身组织的细胞的抗体，统称为自身抗体。如果是产生针对细胞核的抗体，就称之为抗核抗体。这些抗体都会对人体产生很大的危害，也叫有害抗体，往往都是一些自身免疫病的元凶。
如果乙肝合并自身免疫性肝炎同时存在，主要就是以控制乙肝病毒感染。对于自身免疫性肝炎，可以口服优思弗，也就是熊去氧胆酸积极的控制病因。通过控制病因后，病情多数趋于稳定，发生肝硬化的几率也会大大减小，但是一定要控制好病毒。同时也要嘱咐病人多注意休息、注意饮食，提高自身的免疫功能。而且注意保证心理的平和，不要过于焦虑。