马鞭草有活血化瘀的功效和截疟的作用，马鞭草可以解毒，也有利水、消肿的功效。马鞭草味苦性凉，入肝经、脾经。马鞭草可以用于妇科病的治疗，可以用于闭经、痛经，有活血化瘀的作用。此药也可以用于妇科包块，即症瘕、积聚，也就是卵巢囊肿、子宫肌瘤的治疗，可以起到散淤滞的作用。
马鞭草可以治疗疟疾，有截疟之功。马鞭草对于咽喉肿痛有治疗作用，可以起到散瘀的功效。另外，马鞭草对于各种痈、肿，可以起到解毒、化瘀的作用，并且对于水肿、尿频、尿急、尿涩、尿热、尿痛等泌尿系感染，可以起到利水消肿的功效。