临床引起胆总管扩张的原因有很多，但主要的症状还是胆管炎，表现为剑突下或右上腹疼痛，还可以伴有右肩部放射痛，同时有发热、恶心、呕吐、腹胀的临床症状。
部分患者还会出现高热、寒战，体温可以达到39-40℃。还有可能出现黄疸的症状，黄疸既可以呈波动性，也可以进行性加重。小便颜色可以加深，呈浓茶色，而大便颜色可以变浅，
主要见于结石或者肿瘤所造成的胆道梗阻。如果胆管下段结石造成的，还有可能引起较为明显的胆源性胰腺炎，早期可能表现为右上腹疼痛，逐渐转移至左中上腹，可以出现明显的腰部疼痛伴有明显的腹胀。如果胆总管扩张是先天性胆管扩张症，这时可以在腹部触及包块，并且有比较明显的压痛感觉。