自己清理扁桃体结石，可以养成多漱口习惯，可以用钝的筷子头，将结石轻轻拨出，要避免用尖锐的东西来清理，以免造成黏膜的划伤、感染，或者造成隐窝口的粘连、堵塞等症状。如果难以清理，最好到医院进行扁桃体隐窝的灌洗，或者将结石清理。
扁桃体结石是隐窝型的扁桃体炎常见的症状，病人经常会在隐窝口有黄白色颗粒样的东西，或者咳出黄白色颗粒样的东西，有臭味，也会有咽部异物感、磨的感觉，有口臭、口腔异味等。如果症状比较明显，难以耐受，也可以考虑行扁桃体的切除手术。