多囊卵巢与卵巢囊肿的区别就在于形态上的不同，卵巢囊肿是指在卵巢上发现有单个的囊性包块，在临床上往往没有症状。多囊卵巢是双侧卵巢呈现多囊样的改变，并且这种多囊样的改变就是由于卵泡造成的，这种卵泡每一个都不会发育成熟，会造成不排卵的现象，而卵巢囊肿在临床上仍然会有排卵的现象，所以这是两者的区别。另外，卵巢囊肿需要做手术给予治疗，而多囊卵巢在临床上不需要手术，用药物可以治疗，这也是两者的区别。