临床上治疗焦虑强迫症主要采用药物治疗、心理治疗的方案。药物治疗在临床上具有一线治疗作用的，如帕罗西汀、舍曲林、氟伏沙明、氟西汀等药物。
在治疗过程中要全病程系统规范的治疗，在心理治疗过程中，主要针对患者进行认知行为治疗，包括对于强迫症患者的症状以及应对方案进行系统规范的认知心理教育。告诉患者引发其强迫的行为主要是强迫思想导致的，而焦虑也是强迫思想导致的。
所以在治疗过程中，要根据焦虑程度从小到大排列症状清单，帮助患者暴露的强迫行为和强迫思维之下，通过暴露反应预防的治疗方法来帮助患者学会忍耐焦虑体验，通过减少强迫行为，消除强迫行为，进行强迫症的系统规范的治疗可以取得良好的治疗效果
在此期间要给予患者支持性心理治疗，帮助患者树立治疗的信心和决心，可以取得更加良好的治疗效果。