自身免疫性脑炎的治疗方法，主要是免疫抑制治疗或者免疫调节治疗。自身免疫性脑炎是免疫异常导致的脑功能障碍，多半是影响了边缘系统，而引起记忆力减退、嗜睡、意识障碍、癫痫发作等。
自身免疫性脑炎由于是自身免疫性疾病，治疗方法主要是免疫调节或者免疫抑制，目前最常用的是大剂量的激素、糖皮质类固醇激素，进行冲击治疗等。也可以使用丙种球蛋白、口服免疫抑制剂、血浆置换，甚至于单克隆抗体等，都可以用于自免脑炎的治疗。