睡觉被呛醒都要考虑以下两种情况：
一、上气道咳嗽综合征，也叫做鼻后滴漏综合征，也就是存在鼻炎和鼻窦炎的病人，由于鼻腔内的分泌物增多，不能够及时排出，在夜间睡眠时导致鼻腔里的分泌物向咽喉部滴漏，刺激咽喉产生呛咳，甚至呛醒。
二、反流性胃-食管炎，由于胃酸分泌过多，引起胃和食管产生反流的现象，在夜间睡眠时食道的张力下降，胃内容物形成反流至咽喉部，进入声门和气管，产生呛咳现象。因此睡觉时被呛醒要及时就诊，行鼻镜或者胃镜以明确诊断。