不同的肝炎有不同的治疗方案，也有不同的治疗药物。临床上比较常见的是病毒性的肝炎，治疗主要是需要抗病毒治疗，抗病毒的药物包括两大类，即核苷类似物和干扰素，核苷类似物包括一线用药的恩替卡韦、替诺福韦，以及目前应用的TAF，EB病毒感染可以用更昔洛韦治疗，为病因治疗。
甘草酸制剂也在临床广泛的应用，可以抑制肝细胞的炎症，降低转氨酶，起到一个护肝的作用，临床上应用主要是复方甘草酸苷、异甘草酸镁、甘利欣等。清除肝脏氧自由基的药物是还原型谷胱甘肽，主要用于酒精肝和药物性肝损伤。稳定肝细胞膜的药物可以修复肝细胞，为多烯磷脂酰胆碱。如果存在淤胆，可以应用熊去氧胆酸和思美泰。