气管和食管的位置相临近，两者都处在颈部正中位置，或者胸骨后面正中位置，气管在前而食管在后，两者拥有共同的门户，也就是咽喉部。
但是，气管和食管虽然解剖位置邻近，却属于两个不同系统的器官，气管属于呼吸系统的器官，而食管则是消化系统的器官。两者的功能也不相同，气管是气体进出的通道，起到肺的通气功能，而食管则是消化的通道，就是食物进出的通道，所以食管和气管两者有着根本性的区别。