结直肠炎有很多种，最常见的是感染性结直肠炎，感染性结直肠炎又分为病毒感染和细菌感染。病毒感染主要是对症治疗、维持水电解质平衡，细菌感染需要选用针对致病菌的抗生素。
缺血性结肠炎好发于中老年患者，通常好发于左半结肠，对于这类病人需要改善肠道的循环。
溃疡性结直肠炎是自身免疫病，根据病情可以分为轻、中、重三型。轻度溃疡性结肠炎口服美沙拉嗪，疗程需要3-5年，轻、重度的溃疡性结肠炎需要用糖皮质激素诱导缓解，然后再用美沙拉嗪或者免疫抑制剂维持、缓解治疗。