自闭症属于神经发育障碍性疾病，目前并没有确切的形成原因。比较公认的原因为遗传因素和环境因素综合作用的结果，比如在家中就有说话不好的成员或者带氧的环境比较封闭等，都可以导致。另外，与宝宝出生前、出生时和出生后相关的高危因素也有关，比如早产、缺氧缺血性脑病等，都可能会引起自闭症。
另外，还有一种说法是脑部的某个区域，脑血流灌注量较少所导致。但是就目前的CT和核磁并不能进行检测，需要进行功能核磁检测，可以作出诊断。