对于伤寒患者的诊断，必须结合患者的流行病史、临床症状和体征以及实验室检查结果三方面因素，才可做出确定诊断。
首先应了解当地伤寒流行情况，并询问患者工作及生活地点，症状开始及持续时间、症状发生后用药情况等。
其次对患者症状进行排查，如果患者出现持续发热，伴有全身中毒症状，如食欲下降、腹胀、腹痛、腹泻、便秘以及玫瑰皮疹、肝脾肿大等，应怀疑感染伤寒杆菌的可能，可作进一步检测以确定病情。
血液和骨髓培养阳性结果是确诊的主要依据，尤其骨髓培养比血培养阳性率更高，粪便培养阳性也可以确诊。