患者出现肝硬化时，由于增生的纤维素和再生的肝细胞结节挤压肝小叶内肝血窦，从而使其变窄或狭窄，引起了门静脉血流受阻，门静脉的压力也就随之升高。再就是由于位于肝小叶间汇管区的肝动脉小分支，和门静脉小分支之间的许多动静脉交通支平时不开放，而在肝血窦受压或阻塞时大量开放，以致压力高的肝动脉血流直接反注入压力较低的门静脉小分支，从而使门静脉压力进一步增加。
临床上门静脉并无瓣膜，其压力通过流入的血量和流速的阻力形成维持，门静脉血流阻力增加是造成门静脉高压的始动因素。门静脉高压形成以后可以出现明显的病理变化，主要包括脾大、脾功能亢进、体内的交通支扩张，还可以造成明显的腹水。