IgA肾病和急性肾炎属于两种不同的肾小球疾病，两者之间区别很大，通常IgA肾病发病机制到现在并不明确；急性肾炎发病的机制是链球菌感染以后诱发机体免疫紊乱，导致肾小球肾炎的发生。
IgA肾病在感染的数小时之内就会出现血尿；急性肾炎往往是在感染以后1-3周才会出现血尿。IgA肾病属于慢性疾病，是导致尿毒症的原因之一；急性肾炎属于急性疾病，通过治疗以后预后很好，大多数都能够痊愈。
IgA肾病最主要的治疗方法需要使用激素、免疫抑制剂治疗；急性肾炎是不需要使用激素和免疫抑制剂治疗的，所以在临床上这两种疾病不能混淆。