自身免疫性脑炎属于自身免疫病，应该进行免疫抑制或者免疫调节治疗，它是因为机体由于自身免疫的异常产生一些抗体，这些抗体对脑细胞表面和脑细胞质内部的蛋白产生了抗体，而引发了脑细胞的损伤，出现了一系列神经功能缺损的症状。
针对自身免疫性脑炎，首先应该使用大剂量的糖皮质类固醇激素来进行治疗。按照大夫的医嘱，根据患者的情况，选用不同的剂量进行治疗。另外，也可以选用其它的口服免疫抑制剂、丙种球蛋白、单克隆抗体等来进行治疗。