诊断甲肝最可靠的方法是血清学甲肝抗体的检测，临床上甲肝的诊断需要结合患者流行病学史、临床症状体征以及实验室检查结果，主要包括近期的不洁饮食史，比如吃过没有煮熟的海鲜，随后出现发热、乏力、关节痛、腹胀、腹泻、恶心、呕吐、厌油腻，以及黄疸等表现，实验室检查出现肝功能异常，转氨酶明显升高。
另外最重要的检查是甲肝抗体，若检测出甲肝抗体IgM阳性可明确诊断甲型肝炎，且考虑为新近的感染，甲肝IgM抗体从初始感染阶段出现症状时可检出一般持续约四个月，个别可超过一年，甲肝的IgG在发病期，同样可以检出并伴随终生，但是连续两次血清甲肝IgG抗体四倍及以上增高，也可以提示近期感染，个别患者在感染初期两个抗体均呈阴性。随着疾病的进展才逐渐出现，可能预约检测试剂的敏感性有关，所以必要时应该重复检查。