儿童肛周脓肿大部分是需要做手术，行肛周脓肿切开引流的。如果肛周脓肿比较小，可以暂时观察，外用抗生素、局部热敷，促进脓肿的消散、吸收。如果脓肿有生长，就需要做脓肿的切开引流，从而尽快缓解病情。
如果肛周脓肿不手术，有可能脓肿进一步增大，出现自行破溃，破溃以后形成肛瘘。肛瘘会反反复复发作出现脓液积聚和脓肿反复发生的现象，给小孩的生活带来很多困扰，也是需要手术治疗的。