蜂房的主要功效是攻毒杀虫、祛风止痛，同时现代临床应用最广泛的是用于治疗恶性肿瘤，可以与全蝎、僵蚕一起煎药服用。蜂房以毒攻毒功效显著，而且能祛风而止痒，治疗痈肿毒疮、乳腺炎初起，可以蜂房焙黄研末内服，或者煎汤外洗、热敷。
治疗疥疮、头癣可以用蜂房配蜈蚣、蛇蜕，焙焦为粉末外涂。同时蜂房祛风止痛，用于治疗风湿痹痛，常与桂枝、乌头、蜈蚣等同用。治疗荨麻疹、湿疹瘙痒可以与蝉蜕、白藓皮等同用，同时可以单用蜂房治疗牙痛。