扁桃体发炎时牙龈肿痛，从西医方面来讲，考虑是细菌感染所导致，临床上比较常见的包括溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎球菌等革兰氏阳性菌感染。如果伴随牙龈肿痛，也不排除继发厌氧菌感染的可能性。从中医方面来讲，考虑是机体火大所引发的症状，所以可以辅助一些清凉、去火的中成药制剂，比如黄连上清片或者是牛黄解毒丸等。常用的西药抗生素，如阿莫西林或者是头孢克肟，加上甲硝唑或者替硝唑来治疗。
扁桃体发炎时牙龈肿痛，一定要注意口腔的护理，可以用漱口水或者是生理盐水来漱口，比较常用有复方氯己定、康复新液等，饮食上最好还是要清淡一些。