肛窦炎一般经过非手术治疗，包括中药坐浴熏洗、栓剂、膏剂、肛门局部用药、中药保留灌肠等治疗措施，多在一个星期左右症状就会明显改善，炎症消退。但是容易反复发作，不易根治。而手术是根治肛窦炎的一种行之有效的治疗方法，多在经过保守治疗无效，症状反复发作的患者应用。目前治疗肛窦炎的手术方式主要是肛窦挂线术，这种手术方式损伤比较小，患者易于接受，无需住院，随治随走，多在7-10天挂线脱落，疾病就可治愈。而肛窦炎的日常预防尤为关键，主要有以下几点：一、保持肛门局部的清洁卫生；二、膳食搭配合理，保持大便通畅，养成定时排便的良好习惯；三、防治便秘是预防肛窦炎的重要措施，同时还应该积极的预防、治疗腹泻、痢疾、急慢性肠炎等肠道疾患。