多囊卵巢综合征的患者在怀孕后流产的几率高于普通的孕妇，多囊卵巢综合征的患者往往合并内分泌，或者免疫相关的异常。因此，建议患者在早期可以做甲状腺功能、空腹血糖检查。另外，如果曾经有过流产史，建议做免疫相关的检查，注意是否有抗核抗体、抗心磷脂抗体、狼疮抗凝物，除外抗磷脂综合征。
另外，多囊卵巢综合征的患者需要化验血清维生素D、孕酮，如果维生素D比较低，建议及时补充。如果孕酮比较低，也可能出现流产。建议怀孕早期可以做彩超检查，确定是宫内孕还是宫外孕。如果是宫内孕发现孕酮比较低，可以口服地屈孕酮进行保胎。此外，在孕期要注意是否有腹痛和阴道流血。