口蹄疫目前尚没有特效的治疗方法，主要以对症治疗为主，患者入院需要隔离观察，针对病情给予降温、清洁口腔等处理方法，同时还需要防止继发感染。急性期口蹄疫患者应卧床休息，多饮水，并注意口腔清洁，吃容易消化的食物。
对于全身症状明显的口蹄疫患者，要给予对症治疗，发热时给予物理降温，同时可以使用退热药物，还要给予补液，防止发生脱水，也要清淡饮食，可用2%-3%的双氧水或0.1%的过锰酸钾溶液，来清洗黏膜溃疡、漱口。由于存在着个体差异，用药不存在最好、最快、最有效的药物，可以根据患者具体情况来选择合适的药物。